위안소는 보통 업자가 경영관리하고 있었으나, 군은 여러 면에서 위안소의 존립, 가동에 관여하였습니다. 이는 현지 부대가 정한 각종 관리규정에서 엿볼 수 있습니다.

우선 위안소의 건물은 군이 제공하거나 건설하였습니다. 군이 경비하며 나아가 영업시간, 휴업, 단가, 부대별 이용일 할당도 군이 결정했습니다. 위안부의 성병검사도 군이 담당하였습니다. 군은 관리위원을 지명하여 위안소에 갈 사람을 위하여 군이 이용권을 발행하는 경우도 많이 보였습니다.